ADAGE : Algorithmique discrète et ses applications à la génomique

En savoir plus sur l'équipe : Site de l'équipe Rapport d'activité La médiathèque Rapports de recherche Thèses Thème : Bio Systèmes biologiques Centre de recherche Nancy - Grand Est

ADAGE a été arrêté le 01/01/2006

Présentation de l'équipe

Equipe du LORIA commune avec le CNRS, les universités Henri Poincaré, Nancy 2 et INPL

L'objectif général de l'équipe ADAGE consiste à mettre au point des algorithmes efficaces sur les structures discrètes (telles que mots, arbres, graphes, cartes, polyominos, ...), qui sont souvent basés sur des études théoriques profondes de propriétés combinatoires de ces structures. Le champ d'applications privilégié de ces travaux est la bioinformatique, domaine dans lequel les modèles discrets apparaissent de façon naturelle et essentielle. Une attention particulière est portée au développement de logiciels expérimentaux basés sur des algorithmes mis au point dans le projet.

Axes de recherche

• Algorithmique et combinatoire des mots
• Géometrie discrète
• Aléa discret
• Bioinformatique

Les logiciels grappe et mreps d'analyse de textes sont développés dans le projet.

Relations internationales et industrielles

Coopérations scientifiques : Université Marne-la-Vallée, LaBRI, LIX, IGBMC, projet ALGO à l'INRIA, Université Lumière Lyon 2, INRA, LLAIC, Université de Strasbourg, Université Carlton, UQAM (Canada), Microsoft Research (USA), Université de Moscou, Université de Varsovie

Responsable scientifique

Gregory KUCHEROV
+33 3 83 59 30 21
Gregory.Kucherov@inria.fr